【化学】「プラスチックを素早く分解する酵素」が機械学習モデルを利用して開発される [すらいむ★]

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1すらいむ ★2022/05/20(金) 21:38:59.95ID:CAP_USER

「プラスチックを素早く分解する酵素」が機械学習モデルを利用して開発される

　プラスチックは一般的に石油を原料として作られた合成樹脂であり、水に強く腐食しにくいといった性質から工業製品や包装などさまざまな分野で利用されていますが、分解されにくいため環境への影響が問題となっています。
　そんなプラスチック廃棄物の問題を解決するため、テキサス大学オースティン校の研究チームは機械学習を使って、「本来なら分解に数世紀かかるプラスチックを数時間～数日で分解する酵素」を作り出しました。

　Machine learning-aided engineering of hydrolases for PET depolymerization | Nature
　https://www.nature.com/articles/s41586-022-04599-z

（以下略、続きはソースでご確認ください）

Gigazine 2022年05月20日 09時00分
https://gigazine.net/news/20220520-plastic-eating-enzyme-machine-learning/

2名無しのひみつ2022/05/20(金) 21:39:53.08ID:os8DaXNY

ちょっと待って、これ革命起きんじゃないの？

3名無しのひみつ2022/05/20(金) 22:34:01.39ID:3M5Qc6RG

すごすぎね？

4名無しのひみつ2022/05/20(金) 22:58:46.55ID:FhGSL6Bn

>>2
>>3
すごい
ただ、いくらAIでも、もし解が無ければ新しい酵素は見つからない

何が言いたいかと言えば、リチウムイオン電池みたいな素材は既に探し尽くされててもう新しい候補なんか無いので、いくらAIでも見つからない
反対に、リチウムイオン電池よりも未開拓領域だと少数のサンプルでも効率的にAIで nature級の発見を簡単に成し遂げられる

まあ、適材適所よな

5名無しのひみつ2022/05/20(金) 23:25:59.78ID:ThIO2Mjk

32ドルか。うーん

6名無しのひみつ2022/05/20(金) 23:46:48.12ID:h+IvLQHn

>>1
ソニー「これは使える！」

7名無しのひみつ2022/05/21(土) 01:08:48.71ID:Df7zR4it

計算上じゃなく実際に作れたの？

8名無しのひみつ2022/05/21(土) 01:32:26.31ID:JI+imvkb

まじでこれ？
すごすぎんよースパイ防止法はよ

9名無しのひみつ2022/05/21(土) 02:00:30.87ID:6Wp4wSQA

これがマイナスチック

10名無しのひみつ2022/05/21(土) 02:24:01.97ID:fJD27v/x

日本人はカス民族。世界で尊敬される日本人は大嘘。

日本人は正体がバレないのを良い事にネット上で好き放題書く卑怯な民族。
日本人の職場はパワハラやセクハラ大好き。学校はイジメが大好き。
日本人は同じ日本人には厳しく白人には甘い情け無い民族。
日本人は中国人や朝鮮人に対する差別を正当化する。差別を正義だと思ってる。
日本人は絶対的な正義で弱者や個人を叩く。日本人は集団イジメも正当化する。 (暴力団や半グレは強者で怖いのでスルー)
日本人は人を応援するニュースより徹底的に個人を叩くニュースのが伸びるいじめっ子民族。

日本のテレビは差別を煽る。視聴者もそれですぐ差別を始める単純馬鹿民族。
日本の芸能人は人の悪口で笑いを取る。視聴者もそれでゲラゲラ笑う民族性。
日本のユーチューバーは差別を煽る。個人を馬鹿にする。そしてそれが人気の出る民族性。
日本人は「私はこんなに苦労したんだからお前も苦労しろ！」と自分の苦労を押し付ける民族。

日本人ネット右翼は韓国中国ロシアと戦争したがるが戦場に行くのは自衛隊の方々なので気楽に言えるだけの卑怯者。
日本人馬鹿右翼の中年老人は徴兵制度を望むが戦場に行くのは若者で自分らは何もしないで済むので気楽に言えるだけの卑怯者。
日本人の多くは精神科医でも無いただの素人なのに知ったかぶり知識で精神障害の人を甘えだと批判する(根性論) 日本人の多くは自称専門家の知ったかぶり馬鹿。
日本人は犯罪者の死刑拷問大好き。でもネットに書くだけで実行は他人任せ前提。拷問を実行する人の事を何も考えていない。日本人は己の手は汚さない。
というかグロ画像ひとつ見ただけで震える癖に拷問だの妄想するのは滑稽でしか無い。
日本人は鯨やイルカを殺戮して何が悪いと開き直るが猫や犬には虐待する事すら許さない動物差別主義的民族。

日本人は「外国も同じだ」と言い訳するが文化依存症候群の日本人限定の対人恐怖症が有るので日本人だけカスな民族性なのは明らか。
世界中で日本語表記のHikikomori(引きこもり)Karoshi(過労死)Taijin kyofushoは日本人による陰湿な日本社会ならでは。
世界で日本人だけ異様に海外の反応が大好き。日本人より上と見る外国人(特に白人)の顔色を伺い媚びへつらう気持ち悪い民族。
世界幸福度ランキング先進国の中で日本だけダントツ最下位。他の欧米諸国は上位。
もう一度言う「外国も一緒」は通用しない。日本人だけがカス。カス民族なのは日本人だけ。

陰湿な同級生、陰湿な身内、陰湿な同僚、陰湿な政治家、陰湿なネットユーザー、扇動するテレビ出演者、他者を見下すのが生き甲斐の国民達。

冷静に考えてみてほしい。こんなカス揃いの国に愛国心を持つ価値などあるだろうか。今まで会った日本人達は皆、心の優しい人達だっただろうか。学校や職場の日本人は陰湿な人が多かったんじゃないだろうか。
日本の芸能人や政治家も皆、性格が良いと思えるだろうか。人間の本性であるネットの日本人達の書き込みを見て素晴らしい民族だと思えるだろうか。こんな陰湿な国が落ちぶれようと滅びようと何の問題があるのだろうか？

11名無しのひみつ2022/05/21(土) 02:27:28.17ID:WkuN/J8e

ちょっとプールに流してくる

12名無しのひみつ2022/05/21(土) 03:49:24.87ID:0FE73Hl8

人もあっというま

13名無しのひみつ2022/05/21(土) 06:05:24.02ID:r9xePojU

＼ピコーン／

14名無しのひみつ2022/05/21(土) 08:58:43.89ID:1RWbS8gR

水着が溶ける酵素！ピコーン

15名無しのひみつ2022/05/21(土) 09:18:43.75ID:Us1qlZWG

>「この研究は合成生物学・化学工学・人工知能など、異なる分野が融合することの力をはっきり示しています」とコメント

まさにAIとの融合だな

16名無しのひみつ2022/05/21(土) 09:23:23.34ID:Yb5lqRdt

みなさん、プラスチックは何から出来ているか知ってましたか？

17名無しのひみつ2022/05/21(土) 10:04:24.29ID:AYs98Pe0

プラスチックなんて石油と同じで自然の環境で分解される
ただ、時間が掛かるだけだ
生分解プラスチックの開発も進まなくなった理由も必要が無いのが判ったから

18名無しのひみつ2022/05/21(土) 10:35:50.46ID:5S58KmxE

分解して何になるのだろう？
プラスチックの原料に戻るなら、プラスチックが再生可能になる。

19名無しのひみつ2022/05/21(土) 10:48:57.01ID:9Byug+jO

こういう積み重ねの果てに月光蝶

20名無しのひみつ2022/05/21(土) 10:54:13.59ID:XjyFubXU

人類文明の終わりの始まりである

21名無しのひみつ2022/05/21(土) 11:08:03.52ID:N6IpHaQZ

>>1
ホントかなぁ？
でも、ホントならその酵素を増産して販売すればものすごく利益あげられるね

22名無しのひみつ2022/05/21(土) 14:45:55.76ID:RZGrrNKx

先日ゴキブリが良い音をさせながら発泡トレイを齧っていた
洗ってリサイクル回収させるためのトレイだった
実はゴキブリはふわふわになってるプラスチックを食べている

>>10
荒らし行為はご遠慮ください

23名無しのひみつ2022/05/21(土) 14:46:54.72ID:RZGrrNKx

見た目もプラスチックぽい

24名無しのひみつ2022/05/21(土) 14:57:45.79ID:6iyy725S

機械学習モデルでどうやって酵素の突然変異を作ったんだ？
突然変異のDNA構成からどの突然変異が分解効果が1番高そうか予測したってこと？

25名無しのひみつ2022/05/21(土) 14:59:40.82ID:0RCasChV

>>16
石油

26名無しのひみつ2022/05/21(土) 15:07:05.68ID:q/CYRmF9

遺伝的アルゴリズムで新たな酵素を作りましたってwww

そんなん、そこらの細菌がとっくにやってることで、効果が異なるのはその細菌の
生存に都合が悪い進化はしないからだって

27名無しのひみつ2022/05/21(土) 15:35:23.81ID:3ozYvTPf

>>1
燃やせばいいんじゃね？

28名無しのひみつ2022/05/21(土) 19:15:18.53ID:j/zVzhi+

>>26
> 遺伝的アルゴリズムで新たな酵素を作りましたってwww

論文のどこにもそんなことは書かれてないがどうした？？？

29名無しのひみつ2022/05/21(土) 19:40:37.42ID:q/CYRmF9

>>28
お前には、論文にmutationって言葉が出てくることの意味がわかってないのは、わかった

30名無しのひみつ2022/05/21(土) 22:12:53.35ID:/eK90gMc

>>24
alphafold2でも使ったのかなあ

31名無しのひみつ2022/05/21(土) 22:32:47.51ID:j/zVzhi+

>>29
mutationが出てくる！遺伝的アルゴリズムだ！

って思っちゃったの？論文の内容を一切理解できてないやん

32名無しのひみつ2022/05/22(日) 00:24:30.34ID:tBoFD1uu

こういうのって全部東大の菅せんせーのやってるin vitroのペプチド進化法でよくね？

33名無しのひみつ2022/05/22(日) 01:16:55.73ID:18QRVV33

>>31
>mutationが出てくる！遺伝的アルゴリズムだ！
>って思っちゃったの？

もうちょっと読めればもっと理解できるが、mutationすらわからなかったお前はそれ以前に問題あるから

>論文の内容を一切理解できてないやん

お前がな

34名無しのひみつ2022/05/22(日) 03:32:37.22ID:k84W88b5

悪魔酵素じゃん有害物質じゃん

35名無しのひみつ2022/05/22(日) 06:00:08.92ID:3FwOnAGZ

世界中のプラスチック製品がボロボロになる

36名無しのひみつ2022/05/22(日) 10:55:41.96ID:DgegAKNy

>>33
> mutationすらわからなかったお前はそれ以前に問題あるから

いきなりmutationに言及し出したのはお前であって、俺は分からなかったなんて一言も書いてないよ。妄想が過ぎる

そして、この論文における"mutation"とは遺伝的アルゴリズムで設定する変異のことではない

CNNをつかってタンパク質中の最適な変異構造を予測するMutComputeというフレームワークを論文では使っており
"mutation"はアミノ酸基の変異そのものを指してる

37名無しのひみつ2022/05/22(日) 11:46:05.50ID:18QRVV33

>>36
>そして、この論文における"mutation"とは遺伝的アルゴリズムで設定する変異のことではない
>CNNをつかってタンパク質中の最適な変異構造を予測するMutComputeというフレームワークを論文では使っており
>"mutation"はアミノ酸基の変異そのものを指してる

それ、アミノ酸基の入れ替えを変異にした遺伝的アルゴリズムだってだけの話だのに、お前何もわかってないな

38名無しのひみつ2022/05/22(日) 12:04:18.11ID:as2OtRAW

>>37
これGAといって良いのかなあ
既知のさまざまなタンパク質の構造を元に熱的安定性を高める変異箇所を計算機に予測してもらって
その解答箇所を変異させて酵素の性能を調べてみたって話で、
変異する場所は計算機が出した解しかやってないから別に何度も試行錯誤を重ねているわけでは無いのでは

39名無しのひみつ2022/05/22(日) 12:16:45.75ID:18QRVV33

>>38
関連論文に、

s://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acssynbio.0c00345
gain-of-function mutations

ってあるんだから熱的安定性だけの話じゃないし、

Amalgamation of these mutations

ってあるんだから、変異をいろいろ組み合わせてるわけで、立派なGAだろ

40名無しのひみつ2022/05/22(日) 16:46:00.73ID:as2OtRAW

>>39
熱的安定性はPETaseにおいて解決しなければならない課題であって
MutComputeが扱える分野とは別の話
混同しないように

で、MutComputeにGAってその論文に明記されてる？
評価どうやってやるの？
>Amalgamation of these mutations
だって、単にMutComputeが複数の解を提供するから、そこから適当に組み合わせたら良いのができるかもってだけの話では？

41名無しのひみつ2022/05/22(日) 18:25:02.57ID:DgegAKNy

>>39
>Amalgamation of these mutations
>ってあるんだから、変異をいろいろ組み合わせてるわけで、

うんうん、そうだよね

>立派なGAだろ

は？？？

42名無しのひみつ2022/05/22(日) 18:29:23.48ID:DgegAKNy

>>39
GAならば交叉法・交叉率・突然変異率・選択方式などのパラメーターが論文に書かれてるはずだから
該当箇所を明示してくださいね

43名無しのひみつ2022/05/22(日) 18:46:57.69ID:yxJ0nr6q

プラスチック回収したなら燃やせばいいだけだよね？
環境中に流出したプラスチックをどうするかが問題なんだけど？
その酵素を地球上にばら蒔くの？